Согласно действующему законодательству, воинский учет граждан в организациях осуществляется по документам, перечень и форматы которых устанавливаются Министерством обороны Российской Федерации. При этом, физические лица представляют документы воинского учета только при заключении трудового договора с организацией в соответствии со статьей 65 Трудового кодекса Российской Федерации.
Таким образом, организации не обязаны собирать сведения и документы для ведения воинского учета у физических лиц, с которыми заключены договоры гражданского права (договоры ГПХ). Также организации не обязаны представлять сведения о таких гражданах в военкомат и вести в отношении них воинский учет.
Поэтому, в данном случае, не требуется вести воинский учет в отношении лиц, с которыми заключены договоры ГПХ, и подавать в отношении таких лиц сведения в военкомат.